樱花细菌性根癌病常发生在根颈部，尤其在苗木嫁接口处，有时在侧根、支根或枝（蔓）上也会发生。
癌瘤初生时呈球形，可互相愈合，颜色为乳白色或略带红色，随肿瘤长大，内部木质化变硬，表皮龟裂粗糙并逐渐变成褐至深褐色，癌瘤可小如豆或大如拳。病苗须根较少、生长缓慢或叶黄早落、枯枝增多、花期变短，甚至死亡。该病十分顽固，即使清除癌瘤，往往又可生出。
1、对出圃或外来苗木加强检疫，抛弃病株，发现可疑苗木，应用1％硫酸铜液浸根5分钟再放入2％的石灰水中浸1分钟，也可直接用链霉素溶液泡30分钟栽植观察。
2、按每平方米30克至50克施呋喃丹3％颗粒剂，翻地15厘米至20厘米后浇透水杀灭根结线虫以及地老虎等害虫；嫁接应避免伤口接触土壤，嫁接工具可用75％的酒精或1％的甲醛液消毒。
3、发现病株，应背肿瘤与其周围一起切除，伤口可用医用高度碘酒或用链霉素400国际单位消毒后涂凡士林封闭；病株周围可一次施入硫磺每平方米50克至100克，并灌注20％土霸可湿性粉剂500倍液或14％多效灵水剂150倍液消毒，以后每半月灌消毒液一次，共三、四次即可，在癌瘤切除20天后灌50％吲荼粉剂100至150ppm液以促进植株根系生长，复壮病株。其他处理同前，治疗在早春或夏季根系进入旺盛生长前进行效果较佳。