辣椒灰霉病危害辣椒的整个生育期，主要危害叶片、茎秆、花、果实。苗期发病，初子叶顶端褪绿变黄，湿度大时呈水浸状软腐；后扩展至幼茎，幼茎变细缢缩呈棕褐色，使幼苗病茎折断或萎蔫枯死。成株期发病，初始叶外沿褪绿形成水浸状浅褐色病斑，扩展后呈圆形或椭圆形、褐色并带有浅褐色轮纹的大型病斑，湿度大时病斑上密布灰色霉层，发病末期可使整叶腐烂而死；茎秆和叶柄染病，初生水浸状不规则病斑，病部产生灰白色霉状物，病枝向下蔓延至分杈处；花器染病，花瓣呈褐色，水浸状，上密生灰色霉层；果实染病，幼果果蒂周围局部先产生水浸状褐色病斑，逐渐扩大后呈暗褐色，凹陷腐烂，表面产生不规则轮状灰色霉层。
幼苗发病，子叶先端变黄，水渍状皱缩，向心叶发展，直达幼茎，使茎缢缩变细，整株幼苗很快折断而枯死。病叶易干枯，湿度大时可产生浅灰色霉层。成株的茎部发病，初呈水渍状，不规则形病斑，后变灰白色或褐色，病斑绕茎一周，其上部枝叶萎蔫枯死。花器染病，花瓣上产生褐色或黄褐色斑点，病斑可相连。果实发病多从果蒂处开始，病部果皮呈灰白色水渍状软腐，病斑很快扩展至全果。发病后，在病部均可产生灰白色或灰褐色霉层，病果内或果皮表面可形成黑色粒状菌核。
辣椒灰霉病的危害症状：苗期为害叶、茎、顶芽，发病初子叶先端变黄，后扩展到幼茎，缢缩变细，常自病部折倒而死。成株期为害叶、花、果实。叶片受害多从叶尖开始，初成淡黄褐色病斑，逐渐向上扩展成V形病斑。茎部发病产生水渍状病斑，病部以上枯死。花器受害，花瓣萎焉。果实被害，多从幼果与花瓣粘连处开始，呈水渍状病斑，扩展后引起全果褐斑。病健交界明显，病部有灰褐色霉层。
症状：持续较高相对湿度是造成灰霉病发生和蔓延的主导因素，植株密度过大，生长旺盛，管理不当都会加快此病扩展。幼苗染病，子叶先端变黄，后扩展到幼茎，致茎缢缩变细，由病部折断而枯死；叶片染病，病部腐烂，或长出灰色霉状物，严重时上部叶片全部烂掉，仅余下半截子茎。成株染病，茎上初生水浸状不规则斑，后变灰白色或褐色，病斑绕茎一周，其上端枝叶萎蔫枯死，病部表面生灰白色霉状物；枝条染病，亦呈褐色或灰白色，具灰霉，病枝向下蔓延至分杈处；花器染病，花瓣呈褐色，水浸状，上密生灰色霉层，即病菌分生孢子梗及分生孢子。
幼苗染病，子叶先端变黄，后扩展到幼茎，致茎溢缩变细，由病部折断而枯死；叶片染病，病部腐烂，或长出灰色霉状物，严重时上部叶片全部烂掉，仅余下半截子茎。成株染病，茎上初生水浸状不规则斑，后变灰白色或褐色，斑绕茎一周，其上端技叶萎蔫枯死，病部表面生灰白色霉状物；枝条染病，亦呈褐色或灰白色，具灰霉，病枝向下蔓延至分杈处；花器染病，花瓣呈褐色，水浸状，上密生灰色霉层。
苗期发病，初子叶顶端褪绿变黄，湿度大时呈水浸状软腐；后扩展至幼茎，幼茎变细缢缩呈棕褐色，使幼苗病茎折断或萎蔫枯死。成株期发病，初始叶外沿褪绿形成水浸状浅褐色病斑，扩展后呈圆形或椭圆形、褐色并带有浅褐色轮纹的大型病斑，湿度大时病斑上密布灰色霉层，发病末期可使整叶腐烂而死；茎秆和叶柄染病，初生水浸状不规则病斑，病部产生灰白色霉状物，病枝向下蔓延至分杈处；花器染病，花瓣呈褐色，水浸状，上密生灰色霉层；果实染病，幼果果蒂周围局部先产生水浸状褐色病斑，逐渐扩大后呈暗褐色，凹陷腐烂，表面产生不规则轮状灰色霉层。
辣椒灰霉病苗期为害叶、茎、顶芽，发病初子叶先端变黄，后扩展到幼茎，缢缩变细，常自病部折倒而死。成株期为害叶、花、果实。叶片受害多从叶尖开始，初成淡黄褐色病斑，逐渐向上扩展成V形病斑。茎部发病产生水渍状病斑，病部以上枯死。花器受害，花瓣萎焉。果实被害，多从幼果与花瓣粘连处开始，呈水渍状病斑，扩展后引起全果褐斑。病健交界明显，病部有灰褐色霉层。
苗期、成株期均可发病。幼苗染病，芽端枯死变黄，扩展到茎，茎变干变细，发病部位易折断枯死，发病重的幼苗成片死亡。长出叶子后，叶子染病出现半圆至近圆形淡褐色纹斑，后期叶片或茎均可长出灰霉，使发病部位腐烂。移栽后叶子染病，叶边先有水浸状大斑，后变褐成椭圆或近圆形浅黄色纹斑，且长满灰色霉层，严重的可使大斑连片，整片叶子干枯。辣椒染病，辣椒顶端周围部分先产生水浸状褐色病斑，扩大后呈暗褐色，凹陷腐烂，表面产生不规则轮纹状灰色霉状物。
辣椒灰霉病从辣椒苗期到成株期都可以发病，苗期主要危害辣椒幼苗的幼叶、嫩茎和顶芽，造成子叶发黄、幼茎细缩、植株倒伏死亡。成株期主要危害辣椒的叶、茎、花、果，叶片受害后会出现黄褐色的V性病斑，茎秆受害后出现水浸状病斑，导致病害部位以上的枝叶干枯死亡。花期受害后会造成花朵萎焉脱落，果实受害后会造成果面出现水浸状病斑，并导致整个果实变褐腐烂，湿度较大的情况下经常有灰褐色的霉层出现。灰霉病严重时，会导致辣椒发生烂叶柄、烂花、烂茎、烂果以及死棵的现象。
主要危害叶片、茎秆、花、果实。苗期发病，初子叶顶端褪绿变黄，湿度大时呈水浸状软腐；后扩展至幼茎，幼茎变细缢缩呈棕褐色，使幼苗病茎折断或萎蔫枯死。成株期发病，初始叶外沿褪绿形成水浸状浅褐色病斑，扩展后呈圆形或椭圆形、褐色并带有浅褐色轮纹的大型病斑，湿度大时病斑上密布灰色霉层，发病末期可使整叶腐烂而死；茎秆和叶柄染病，初生水浸状不规则病斑，病部产生灰白色霉状物，病枝向下蔓延至分杈处；花器染病，花瓣呈褐色，水浸状，上密生灰色霉层；果实染病，幼果果蒂周围局部先产生水浸状褐色病斑，逐渐扩大后呈暗褐色，凹陷腐烂，表面产生不规则轮状灰色霉层。