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在玉米生产上，引起茎腐病的原因有多种，最重要的一类是真菌型茎腐病。
玉米茎腐病可由真菌、细菌等不同的致病菌引起，病部腐烂没有恶臭味的，多由腐生性的真菌引起，伴有恶臭味的，多由细菌引起，或者由腐生性真菌和细菌混合侵染引起。
