预防首选是要预防蚜虫、蓟马、粉虱、螨类等害虫，防治蚜虫可以使用高效氯氟氰菊酯和吡虫啉、噻虫嗪、呋虫胺等，防治蓟马可以使用阿维菌素、多杀霉素、噻虫嗪，防治粉虱可以使用呋虫胺等，防治螨虫一般使用阿维菌素、螺螨酯、乙螨唑。
首先要防治好飞虱、蚜虫和蓟马，其泛在发病初期用病毒展叶灵加芸苔素内酯兑水喷雾防治。
选育（用）抗病品种是防治辣椒病毒病最有效的方法，对辣椒病毒病较为抗病、耐病的甜（辣）椒品种有嘉配5号甜椒、海丰1号甜椒、双丰甜椒、上海圆椒和上海甜椒等。不同地区应根据当地的气候条件和种植方式有针对性选择抗病品种。