玉米苗期的主要害虫有蓟马、玉米旋心虫、麦秆蝇三代、麦秆蝇四代、粘虫飞虱、叶蝉、盲蝽蟓类、红蜘蛛等害虫。玉米处于苗期的时候虽然会受到较多的害虫的危害，但是这些害虫的发生时间一般都比较集中，因为其危害时间也相对短一点，一般只要及时做好防护工作便能减少损害。
玉米最常见的虫害就是玉米面和玉米粘虫。
主要有大小斑病纹枯病粗缩病瘤黑粉病黑穗病等。
玉米苗期最常见的病害是蚜虫和旋心虫。
玉米苗期病害主要有玉米根腐病、顶腐病、粗缩病等，若不及时防治，将会对玉米生产造成很大影响。
主要有:黄叶苗、白化苗、红叶苗、紫叶苗、黄绿苗、粗宿病、矮花叶病。