病菌主要在病种子和病草上越冬。病菌主要借雨水、流水等传播，从气孔和微伤口侵入，在薄壁组织的细胞间繁殖扩展。高温多湿，特别是台风暴雨频繁的年份易诱发。
水稻细菌性条斑病主要发生在早稻，晚稻中后期。
高温高湿有利于病害发生。台风暴雨造成伤口，病害容易流行。偏施氮肥，灌水过深加重发病。病菌主要在病稻种、稻草和自生稻上越冬，成为主要初侵染源。病菌主要从气孔或伤口侵入，借风、雨、露等传播。在无病区主要通过带菌种子传入。高温高湿有利于病害发生。晚稻比早稻易感染，后期水稻易发病蔓延；台风暴雨造成伤口，病害容易流行；偏施氮肥，灌水过深加重发病；晚稻在孕穗、抽穗阶段发病严重。