小麦叶锈病发病原因包括：越冬的叶锈病病菌量过多、入春后气温回升快、降水量多、小麦对叶锈病的抗性比较低等。该病是由小麦隐匿柄锈菌侵染所引起的发生在小麦上的病害，病原菌在生物学分类上属于担子菌纲、锈菌目、柄锈菌科、柄锈菌属真菌，在小麦上形成夏孢子和冬孢子，萌发侵入适温为15-20℃，发育适温为17-22℃，湿度不低于80%，小麦隐匿柄锈菌可多次重复侵染叶面。
一、小麦叶锈病是什么引起的
1、小麦叶锈病由小麦隐匿柄锈菌侵染所引起。小麦隐匿柄锈菌属真菌界、担子菌（亚）纲、锈菌目、柄锈菌科、柄锈菌属，为转主寄生的长环生活史型锈菌，在小麦上形成夏孢子和冬孢子。夏孢子单胞，球形至近球形，黄褐色，表面具细刺，有散生发芽孔6-8个。冬孢子双胞，棒状，顶平，柄短暗褐色，萌发后产生担孢子。
2、小麦隐匿柄锈菌夏孢子萌发后产生芽管从叶片气孔侵入，在叶面上产生夏孢子堆和夏孢子，进行多次重复侵染。萌发侵入适温为15-20℃，发育适温为17-22℃，湿度不低于80%。发病原因包括：越冬的叶锈病病菌量过多；入春之后气温回升快；降水量多；小麦对叶锈病的抗性比较低等。
二、小麦叶锈病的流行规律
1、冬小麦播种早、出苗早、发病重，一般9月上、中旬播种的易发病。冬季气温高，雪层厚，覆雪时间长，土壤湿度大发病重。毒性强的小种多，能使小麦抗病性“丧失”，造成大面积发病。
2、越冬菌源多、春季气温高、雨水多，尤其是小麦抽穗前后降雨多，或田间小气候湿度高，叶锈病往往容易流行。
3、中国北方春麦区，小麦叶锈病病原菌不能在当地越冬，因此病菌从外地传来，引起发病。